Ошибка возникает из-за того, что в одном документе указаны сразу несколько профилей ВИМИС и в ВИМИС на отправку формируется несколько СЭМДов по разным профилям.
ВИМИС принимает только 1 сэмд, по одному документу. 


На данный момент ошибку не исправить ни как.
Если же в одном документе  2 профиля (допустим онко и ссз), то сформируется 2 сэмда по разным профилям. Тот, который отправится первый, будет зарегистрирован, по второму придет ошибка что "документ ранее был загружен". Это дорабатывалось на стороне ВИМИС. Теперь идет доработка с нашей стороны в рамках развития.
После доработки , данная проблема будет устранена.